由于石油等傳統能源產量無法滿足日益增長的能源消費需求，印尼近年來開始大力開發生物能源、地熱資源等清潔能源，計劃建成“清潔能源大國”，最近還宣布將通過強制性法規支持其發展。印尼政府計劃逐步提高生物燃油消費比率，力爭在2025年使這一數字達到25％的水平。
印尼出口商聯合會秘書長迪甘托羅近日表示，印尼擁有全球40%的地熱資源，而且盛產棕櫚與蓖麻等可制造清潔能源的原料作物，政府若能妥善管理，必可充分發展這些能源，使印尼成為生產可再生潔凈能源的大國。印尼政府鼓勵企業生產棕櫚油和蓖麻油，并把這兩種產業用作可再生的清潔能源產業，給予津貼等加以鼓勵。為了滿足生物燃料產能增加的需求，印尼最近幾年大力開發生物燃料植物園，目前耕種面積已達102.4萬公頃。預計到2010年末，印尼用于生物能源生產的油櫚棕種植面積將達到約346萬公頃。
印尼多家大型私人財團和國營種植園有著悠久的種植經濟作物傳統，目前它們都在蘇門答臘島、加里曼丹島和巴布亞等人煙稀少的地區“圈地”開發生物能源產業，并極力爭取政府支持。此外，日、韓及中東一些國家的大企業也紛紛籌劃在印尼建生物燃料基地。在生物燃料技術方面，印尼已與澳大利亞、美國、日本等國家建立廣泛合作。去年巴西總統盧拉訪問印尼期間，巴印兩國還簽署了有關生物乙醇技術合作的協議，雙方承諾將加強生物能源領域的合作。
除生物能源外，印尼另一個具有巨大優勢的新能源為地熱資源。資料顯示，印尼地熱能源發電量可達2700萬千瓦，占全球地熱資源的40％，不過印尼已開發的地熱發電量只有99.2萬千瓦，在印尼全國能源比例中的比重不足4％。由于多種原因，現階段印尼地熱能源開發和利用率十分有限。
2002年后，印尼政府將開發地熱資源的權力從國家石油公司劃轉至能源和礦產資源部，由能源和礦產資源部向境內外投資商頒發開發許可證。目前，印尼準備投資6億美元，在北蘇門答臘省建設全球最大的地熱發電站，其總發電能力約為33萬千瓦。而10余家外國企業也等著開發印尼地熱能源的機會。印尼政府計劃，到2020年全國地熱發電將達到600萬千瓦。
