據了解，我國近兩年每年生產的10萬噸生物柴油，一部分銷售到企業所在地區的加油站，還有一部分出口海外。在我國能源緊缺的情況下，生物柴油不在國內市場銷售而尋求海外市場，主要是由于生物柴油的原料價格遠遠高于以石油為原料的礦物柴油，只有出口才不賠本。
生物柴油產業化面臨的主要問題是成本。據科技部中國生物技術發展中心研究員邱宏偉介紹，生物柴油平均制造成本的75%是原料，其中，以地溝油為原料生產生物柴油的成本為每噸3500元、棕櫚(主要依賴進口)成本近5000元、油菜籽成本為5000多元，麻風樹果實成本為4000元左右。相比之下，以石油為原料的礦物柴油的原料、加工的實際成本僅為每噸3500元左右。
邱宏偉認為，以油料作物、油料林木果實以及廢餐飲油等原料生產生物柴油，不僅可以緩解我國能源緊缺，保障國家的能源安全，還可以促進農民增收，減少餐飲廢棄物對環境的危害，需要國家出臺相應的扶持政策。
目前急需解決的是專供生產生物柴油的油料作物的規?；N植、收購補貼，這需要政府規劃、財政出錢。我國適宜種植油菜籽的地區有666萬公頃冬閑田，如果這些冬閑田得以利用，再通過相關配套措施讓農民種上適合生產生物柴油的油菜品種，生物柴油的原料成本就可以相應地降下來。此外，城市地溝油收集的網絡化建設，油料林木作物的推廣等也需要政府的統一規劃。這樣，生物柴油原料成本的降價空間就會打開，生物柴油的產業化進程才會加快。
邱宏偉認為，國家推動車用乙醇汽油的使用已推出一系列措施，很多地方都用上了乙醇汽油，如果生物柴油達到一定的產業化規模，這些措施也可用于推動生物柴油的使用。
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